30均不小于94.23%,共得到99 930條Unigene,其中47 857條被注釋。3種不同膨大狀態(tài)的天冬中的DEGs有1 429個(gè),GO富集結(jié)果表明,3種不同膨大期天冬的DEGs主要富集于細(xì)胞過程、代謝過程、結(jié)合力與催化活性等功能,同源蛋白簇(clusters of orthologous groups,COG)富集結(jié)果表明,3種不同膨大期的天冬中DEGs主要富集于信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制、碳水化合物轉(zhuǎn)運(yùn)代謝以及細(xì)胞壁/膜/被膜的生物合成。京都基因與基因組百科全書(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析顯示,與根膨大相關(guān)的通路[植物激素信號(hào)傳導(dǎo)、絲裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinases,MAPK)信號(hào)通路、淀粉與蔗糖代謝以及苯丙烷生物合成]為DEGs代表性富集通路。結(jié)合差異基因的注釋信息以及表達(dá)量情況分析表明,多種酶類(SAUR、XTH、LRR-RLPK、SPP、EG、BGLU、TPP、AMY、BAMY、PAL、PER)參與天冬塊根膨大,其中XTH可能是影響天冬塊根的膨大發(fā)育過程的最主要的酶類。結(jié)論 通過對(duì)不同膨大狀態(tài)天冬的高通量轉(zhuǎn)錄組測序,揭示了天冬塊根生長膨大的關(guān)鍵酶基因,可為天冬根系生長膨大的生物學(xué)機(jī)制提供參考。"/>

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首頁 > 過刊瀏覽>2025年第56卷第6期 >2025,56(6):2092-2110. DOI:10.7501/j.issn.0253-2670.2025.06.022
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基于轉(zhuǎn)錄組測序的天冬塊根膨大相關(guān)基因的篩選與分析

Screening and analysis of genes related to root tuber expansion in Asparagus cochinchinensis based on transcriptome sequencing

發(fā)布日期:2025-03-25
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